据深圳市交通运输局初步统计，2022年深圳港集装箱年吞吐量突破3000万标箱大关，达到3003.56万标箱，同比增长4.39%。这是继上海、新加坡、宁波舟山港之后，深圳港成为全球第四个年吞吐量突破3000万标箱的港口。

2022年，深圳市交通运输局会同各相关部门、港口企业积极拓展以深圳港为枢纽港、内河港口为喂给港的粤港澳大湾区组合港体系覆盖范围，积极推进“水水中转”“海铁联运”，大力发展深港跨境水路运输。2022年深圳港新增11个组合港，累计开通了26个组合港，水水中转完成735万标箱，同比增长2%；新增6个内陆港，累计挂牌运营13个内陆港，共有30条海铁联运班列，海铁联运完成约23万标箱，同比增长3%；开通深港跨境水路运输快线，自2022年2月19日开通至今，累计完成集装箱运输144.62万标箱，运输货物688.92万吨。

2022年深圳港基础设施重点项目建设全面加速推进。其中，盐田港区东作业区一期工程全面进入施工阶段，大铲湾二期集装箱码头工程建设前期工作有序开展，建成后全港集装箱吞吐能力将增加600万标箱；小漠国际物流港完成对外开放的验收，将打造成湾区具有优势的整车进出口口岸；宝安综合港区投入运营，以散杂货运输为主，包含少量集装箱运输，为后方物流园提供货物海上运输功能。积极协调中石油在深圳注册保税LNG加注公司，并于2022年11月22日在盐田港区完成首单加注，积极开展船舶保税燃油加注工作，共有4家企业取得了国际航行船舶保税燃料油经营资质，完成加注保税燃料油25.2万吨，销售额总计13.6亿元。